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PCR抑制物的去除

一般来说,可以通过使用适当的样品处理和核酸提取方法、选择更强大的DNA聚合酶来降低PUC抑制物(指能抑制特定酶或蛋白质活性的小分子或化合物)的影响。【1、降低核酸提取中的抑制物残留 】减少取样量重新提取、稀释样品或提取的核酸,可降低模板中的PCR抑制物,这是简单的降低抑制的方法,但是缺点是由于稀释了模板,同时也有可能影响检测灵敏度。【2、提高核酸纯度】

如通过适当增加裂解时间、漂洗次数等方法来获得纯度更高的核酸。【3、通过选择更高效的DNA聚合酶】

DNA聚合酶可以被生物样本中存在的各种化合物降解、变性或降低酶活性。针对检测样品选择合适的DNA酶或预混液,可以有效提高扩增效率,降低抑制作用。例如,Tth聚合酶(提取自嗜热栖热菌)和 Tfl聚合酶(提取自黄栖热杆菌)比常用的Taq聚合酶对血液的抵抗力要强。通过定点突变工程化的Taq聚合酶,增强了对血液和土壤中抑制剂的抵抗力,并提高了对高浓度DNA结合染料的耐受性。例如,Taq聚合酶的突变体对引物模板具有更高的亲和力(突变体的Kd为1.1 nM,野生型Taq为102 nM)。

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